Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec4eQ9R0Q8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms