Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc6Q9R087 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms