Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms