Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms