Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms