Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms