Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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