Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms