Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Ndst3Q9EQH7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Ndst3Q9EQH7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Ndst3Q9EQH7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Ndst3Q9EQH7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Ndst3Q9EQH7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Ndst3Q9EQH7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndst3Q9EQH7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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