Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms