Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l1Q9D9H3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l1Q9D9H3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l1Q9D9H3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms