Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb1Q9D5L7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb1Q9D5L7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms