Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zcchc13Q9D548 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zcchc13Q9D548 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zcchc13Q9D548 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zcchc13Q9D548 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zcchc13Q9D548 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zcchc13Q9D548 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zcchc13Q9D548 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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