Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms