Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Efhd1Q9D4J1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efhd1Q9D4J1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
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