Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms