Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcc1Q9D4H2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms