Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms