Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf1Q9D2H9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf1Q9D2H9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms