Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms