Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ift27Q9D0P8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ift27Q9D0P8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ift27Q9D0P8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ift27Q9D0P8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ift27Q9D0P8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ift27Q9D0P8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift27Q9D0P8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ift27Q9D0P8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift27Q9D0P8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ift27Q9D0P8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift27Q9D0P8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift27Q9D0P8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ift27Q9D0P8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift27Q9D0P8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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