Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms