Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SdhdQ9CXV1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SdhdQ9CXV1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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