Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psmd8Q9CX56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms