Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms