Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx28Q9CWT6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms