Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms