Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930519P11RikQ9CUJ8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms