Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms