Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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