Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms