Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnaja3Q99M87 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms