Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms