Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf2Q99LE6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms