Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdcbp2Q99JZ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms