Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms