Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde6cQ91ZQ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Pde6cQ91ZQ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Pde6cQ91ZQ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Pde6cQ91ZQ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde6cQ91ZQ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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