Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms