Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl3Q91YH5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms