Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i2Q91W29 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms