Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Vmn1r200Q8R281 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Vmn1r200Q8R281 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Vmn1r200Q8R281 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Vmn1r200Q8R281 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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