Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vrk3Q8K3G5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vrk3Q8K3G5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vrk3Q8K3G5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vrk3Q8K3G5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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