Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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