Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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