Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY0

Gatc, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatcQ8CBY0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatcQ8CBY0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatcQ8CBY0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms