Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms