Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms