Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms