Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp40Q8BWR4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp40Q8BWR4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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