Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan9Q8BJU2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan9Q8BJU2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan9Q8BJU2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan9Q8BJU2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan9Q8BJU2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms